На фронт мобилизован в июне 1941 года. В первые дни войны в Новосибирске был создан 486-й " Кузбасский" гаубично-артиллерийский полк, состоявший из добровольцев сибирского края. В составе этого полка Яков Филиппович провел сражения за Москву, участвовал в Курской битве, освобождении Белоруссии, Западной Украины и Польши.

С июля 1945 года Новиков назначен командиром разведывательного отделения 40-й гаубичной артиллерийской бригады. Демобилизован в апреле 1946 года.

После войны Яков Филиппович вернулся в Прокопьевск. До самой пенсии работал на заводе шахтной автоматики. В 1966 году участвовал в ВДНХ. Получил звание ветерана труда.

Награды: 1. Орден " Отечественной войны" I и II степени

2. Орден " Славы" II и III степени

3. Медаль " За отвагу"

4. Медаль " За оборону Москвы"

5. Медаль " За оборону Варшавы"

6. Медаль " За взятие Берлина"

7. Медаль " За победу над Германией"